小麦Ta-UBX1基因的电子克隆和生物信息学分析

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【作者】谭光轩范小芳王俊生李成伟
【作者单位】周口师范学院植物遗传与分子育种重点实验室/周口师范学院生命科学系
【出处】江苏农业科学
【年份】2012
【卷号】第40卷
【期号】第6期
【页码】29-32
【 ISSN 】1002-1302
【关键词】小麦 U-box domain蛋白基因电子克隆生物信息学
【分类号】S512.1
【摘要】用电子克隆方法获得了1个小麦U-box蛋白基因Ta-UBX1,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、基本理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:小麦Ta-UBX1基因全长2059 bp,具有完整的ORF编码框,编码553个氨基酸;在N端存在1个显著的UBX保守结构域,该蛋白序列不存在跨膜区或信号肽;生物信息学分析表明,在序列组成、高级结构及活性位点等方面,与其他禾本科植物的同类U-box蛋白具有高度的相似性。
【基金】河南省基础与前沿技术研究计划项目
【文献类型】期刊