辣椒 GH3基因的电子克隆与生物信息学分析

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【作者】罗丽萍罗火林杨柏云熊冬金
【作者单位】南昌大学生命科学与食品工程学院
【出处】华北农学报
【年份】2013
【卷号】第6期
【页码】24-29
【 ISSN 】1000-7091
【关键词】辣椒 GH3基因电子克隆生物信息学
【分类号】S641.3
【摘要】利用电子克隆技术获得1个辣椒GH3同源基因的cDNA序列,采用生物信息学方法,对该基因所编码的氨基酸从理化性质、分子进化、跨膜结构域、高级结构等多角度进行分析。结果表明,该基因cDNA全长2 140 bp,其开放阅读框为1 791 bp,编码595个氨基酸。编码蛋白含32个磷酸化位点,无信号肽,无跨膜区域,是定位在叶绿体上的亲水性蛋白。通过氨基酸序列比对发现,辣椒GH3蛋白与拟南芥、大豆、烟草、番茄等植物中的GH3蛋白同源性较高。为该基因的基因功能研究提供了理论依据。
【文献类型】期刊

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