油菜蔗糖转化酶基因的电子克隆和生物信息学分析

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【作者】杨万年苏宁
【作者单位】华中师范大学生命科学学院
【出处】生物信息学
【年份】2013
【卷号】第3期
【页码】224-232
【 ISSN 】1672-5565
【关键词】油菜蔗糖转化酶基因电子克隆生物信息学
【分类号】S565.4
【摘要】运用电子克隆技术获得油菜中一个蔗糖转化酶基因cDNA序列,同时根据此段序列设计引物以油菜cDNA为模板进行扩增,经测序得到证实。采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、基本理化性质、跨膜结构域、信号肽导肽、疏水性/亲水性、二级结构、亚细胞定位等方面进行了预测和分析。结果表明:该基因cDNA序列长度为2 150bp,包含一个1 779bp开放阅读框,编码592个氨基酸;该编码蛋白含有蔗糖转化酶的多个典型的保守结构域。同源比对分析显示,该基因编码的氨基酸序列与拟南芥等植物的蔗糖转化酶基因具...
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【基金】国家自然科学基金
【文献类型】期刊